故事讲述了一所国际女校来了一名流着黑色血液的转校生。随着她的到来，很多奇怪的事件发生了。黑色血液的感染似乎在渐渐扩散，为什么她的血液是黑色的？她到底是谁？黑色的谜团正在向一群女高中生逼近。剧集以现代的日本为舞台，呈现出了一段世界观十分怪异的故事。

正在调查坠落在太平洋上的不明飞行物体的海上自卫队二尉有动贵文（大澄贤也），遇到了突然出现的蓝光，受发光体的影响，导致遗传因子标准的变质，变成了凶恶的怪兽THE ONE。之后，他（THE ONE）从防卫厅内的特殊机关BCST（对生物工程学的研究机关）的监视下逃走，从此就没了音训。　　另一方面，航空自卫队F15J飞行员真木舜一（别所哲也），为了…

12年之后的新系列，雾山（小田切让）将从美国FBI回到旧时的时効管理课，另一边、三日月（麻生久美子）已经升任交通课课长补佐，因为等不到雾山回来，期间和刑事课的刑警结婚、后来又离婚的设定。